Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scara5Q8K299 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scara5Q8K299 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms