Protein–RNA interactions for Protein: Q8K259

Gin1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gin1Q8K259 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gin1Q8K259 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gin1Q8K259 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gin1Q8K259 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gin1Q8K259 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gin1Q8K259 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gin1Q8K259 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gin1Q8K259 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gin1Q8K259 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gin1Q8K259 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gin1Q8K259 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gin1Q8K259 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gin1Q8K259 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gin1Q8K259 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gin1Q8K259 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gin1Q8K259 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gin1Q8K259 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gin1Q8K259 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gin1Q8K259 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gin1Q8K259 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms