Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek9Q8K1R7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms