Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Alkbh3Q8K1E6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms