Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cldn34c1Q8K193 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms