Protein–RNA interactions for Protein: Q8K174

Tmem60, Transmembrane protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem60Q8K174 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem60Q8K174 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem60Q8K174 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms