Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt33aQ8K0Y2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt33aQ8K0Y2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms