Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZV4

Rbm41, RNA-binding protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm41Q8JZV4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm41Q8JZV4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm41Q8JZV4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm41Q8JZV4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms