Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rasgef1bQ8JZL7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms