Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TwnkQ8CIW5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TwnkQ8CIW5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms