Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CopaQ8CIE6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms