Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NgefQ8CHT1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NgefQ8CHT1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NgefQ8CHT1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NgefQ8CHT1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NgefQ8CHT1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NgefQ8CHT1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NgefQ8CHT1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NgefQ8CHT1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NgefQ8CHT1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NgefQ8CHT1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms