Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHQ0

Fbxo4, F-box only protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo4Q8CHQ0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo4Q8CHQ0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fbxo4Q8CHQ0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fbxo4Q8CHQ0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fbxo4Q8CHQ0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fbxo4Q8CHQ0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fbxo4Q8CHQ0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fbxo4Q8CHQ0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms