Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nav1Q8CH77 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nav1Q8CH77 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nav1Q8CH77 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nav1Q8CH77 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nav1Q8CH77 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nav1Q8CH77 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nav1Q8CH77 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nav1Q8CH77 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nav1Q8CH77 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nav1Q8CH77 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nav1Q8CH77 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nav1Q8CH77 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nav1Q8CH77 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nav1Q8CH77 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nav1Q8CH77 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nav1Q8CH77 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nav1Q8CH77 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nav1Q8CH77 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms