Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp2Q8CGR7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 947.2 ms