Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup88Q8CEC0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup88Q8CEC0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms