Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
6030452D12RikQ8CD33 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms