Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

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Length 928 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bcas3Q8CCN5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcas3Q8CCN5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms