Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nrip1Q8CBD1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nrip1Q8CBD1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms