Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K3

Srsf12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf12Q8C8K3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf12Q8C8K3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms