Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
N4bp3Q8C7U1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
N4bp3Q8C7U1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms