Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6G0

Ifi27, Interferon, alpha-inducible protein 27, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi27Q8C6G0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifi27Q8C6G0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms