Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnot2Q8C5L3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot2Q8C5L3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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