Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8C5C9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8C5C9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8C5C9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8C5C9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8C5C9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8C5C9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8C5C9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8C5C9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q8C5C9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q8C5C9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q8C5C9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q8C5C9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8C5C9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8C5C9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8C5C9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8C5C9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8C5C9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8C5C9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8C5C9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8C5C9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8C5C9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8C5C9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8C5C9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8C5C9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms