Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csgalnact2Q8C1F4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms