Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Usp37Q8C0R0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp37Q8C0R0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp37Q8C0R0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp37Q8C0R0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp37Q8C0R0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp37Q8C0R0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp37Q8C0R0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp37Q8C0R0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp37Q8C0R0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp37Q8C0R0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp37Q8C0R0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Usp37Q8C0R0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp37Q8C0R0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Usp37Q8C0R0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Usp37Q8C0R0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp37Q8C0R0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp37Q8C0R0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp37Q8C0R0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp37Q8C0R0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Usp37Q8C0R0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Usp37Q8C0R0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Usp37Q8C0R0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp37Q8C0R0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Usp37Q8C0R0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Usp37Q8C0R0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Usp37Q8C0R0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Usp37Q8C0R0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Usp37Q8C0R0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Usp37Q8C0R0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Usp37Q8C0R0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Usp37Q8C0R0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Usp37Q8C0R0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Usp37Q8C0R0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp37Q8C0R0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms