Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpcpd1Q8C0L9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpcpd1Q8C0L9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms