Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZL8

Lmo3, LIM domain only protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo3Q8BZL8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmo3Q8BZL8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms