Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYM7

Rsph4a, Radial spoke head protein 4 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph4aQ8BYM7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsph4aQ8BYM7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rsph4aQ8BYM7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rsph4aQ8BYM7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms