Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm4aQ8BW72 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4aQ8BW72 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms