Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp38Q8BW70 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms