Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Triml1Q8BVP1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms