Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Als2cr12Q8BVM7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Als2cr12Q8BVM7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Als2cr12Q8BVM7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Als2cr12Q8BVM7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Als2cr12Q8BVM7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Als2cr12Q8BVM7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Als2cr12Q8BVM7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Als2cr12Q8BVM7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Als2cr12Q8BVM7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Als2cr12Q8BVM7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Als2cr12Q8BVM7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Als2cr12Q8BVM7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Als2cr12Q8BVM7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Als2cr12Q8BVM7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Als2cr12Q8BVM7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Als2cr12Q8BVM7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Als2cr12Q8BVM7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Als2cr12Q8BVM7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Als2cr12Q8BVM7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Als2cr12Q8BVM7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms