Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ssc5dQ8BV57 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms