Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms