Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRN9

Cc2d1b, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d1bQ8BRN9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms