Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnpy4Q8BQ47 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnpy4Q8BQ47 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnpy4Q8BQ47 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnpy4Q8BQ47 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnpy4Q8BQ47 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnpy4Q8BQ47 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnpy4Q8BQ47 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms