Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Abraxas1Q8BPZ8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms