Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gga3Q8BMI3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms