Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rufy1Q8BIJ7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy1Q8BIJ7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms