Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
D130040H23RikQ8BII3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms