Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdca8Q8BHX3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdca8Q8BHX3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms