Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Susd4Q8BH32 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Susd4Q8BH32 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Susd4Q8BH32 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Susd4Q8BH32 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Susd4Q8BH32 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Susd4Q8BH32 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Susd4Q8BH32 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Susd4Q8BH32 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Susd4Q8BH32 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Susd4Q8BH32 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Susd4Q8BH32 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Susd4Q8BH32 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Susd4Q8BH32 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Susd4Q8BH32 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Susd4Q8BH32 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Susd4Q8BH32 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Susd4Q8BH32 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Susd4Q8BH32 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Susd4Q8BH32 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Susd4Q8BH32 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms