Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npas4Q8BGD7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npas4Q8BGD7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npas4Q8BGD7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npas4Q8BGD7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npas4Q8BGD7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Npas4Q8BGD7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Npas4Q8BGD7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Npas4Q8BGD7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npas4Q8BGD7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms