Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pknox2Q8BG99 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms