Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rnf187Q8BFX1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Rnf187Q8BFX1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Rnf187Q8BFX1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Rnf187Q8BFX1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Rnf187Q8BFX1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Rnf187Q8BFX1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf187Q8BFX1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf187Q8BFX1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf187Q8BFX1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf187Q8BFX1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf187Q8BFX1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf187Q8BFX1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf187Q8BFX1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf187Q8BFX1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf187Q8BFX1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf187Q8BFX1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf187Q8BFX1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf187Q8BFX1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf187Q8BFX1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf187Q8BFX1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf187Q8BFX1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf187Q8BFX1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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