Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srgap3Q812A2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srgap3Q812A2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srgap3Q812A2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srgap3Q812A2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms