Protein–RNA interactions for Protein: Q811W2

Cyp26b1, Cytochrome P450 26B1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26b1Q811W2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp26b1Q811W2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp26b1Q811W2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp26b1Q811W2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms