Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc50Q810U5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms