Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp8Q80YR6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp8Q80YR6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms